Наявність мікроорганізмів в їжу є природний і неминучий явище. Приготування їжі в цілому руйнує більшість шкідливих бактерій, але undercooked продуктів, оброблених харчових продуктів готовий до їсти і мінімально оброблених харчових продуктів, може містити шкідливі бактерії, які є серйозні здоров'я загроз. М'ясо, молочні продукти, і птиці продукти є важливими резервуари для багатьох харчового патогенів, включаючи сальмонели, Campylobacter, Listeria і Escherichia coli O157: H7. Побічні тварини продукти, такі як канал добавки, може також доставити патогенів на їжу тварин (наприклад, сальмонели та яловичина spongiform енцефалопатія). Морепродуктів є інше потенційний джерело харчового патогенів, таких як Vibrio, Listeria, і. інфекційні дози гепатит багатьох з цих патогенів, дуже низька (~ 10 бактеріальних клітин), підвищення вразливості людей похилого віку, дітей та людей з імунологічні недоліків або органу пересадки.