Mikroorganizmalar ve onların yaşam ve nonliving ortamlar arasındaki karşılıklı ilişkileri incelenmesi. Mikrobiyal nüfus ve çevre koşulları ile Kaplıcalar gibi çevresel koşullarda yaşam alanları da dahil olmak üzere, değişen altında büyümeye Göller ve derin deniz termal delikleri tuz tahammül edebiliyoruz. Genellikle hayata düşman kabul koşulları altında extremophiles anılacaktır, bazı mikroorganizmaların büyümesi. Archaebacteria (arke) sahip yüksek sıcaklık, yüksek salinities ve düşük pH büyümeye çok extremophiles. Mikrobiyal denetleme çevresel faktörler gelişim ve hayatta kalma sağlayan mikroorganizmaların doğada dağıtım içgörü ve mikrobiyal ekoloji birçok çalışmaları belirli mikrobiyal türlerin habitatları özellikle işlevine izin Edinilmiş özelliklerin incelenmesi ile ilgili bir anlayış .