A presença de microrganismos nos alimentos é uma ocorrência natural e inevitável. Cozinhar geralmente destrói a maioria das bactérias prejudiciais, mas mal cozidos alimentos, alimentos prontos para consumo e alimentos minimamente processados podem conter bactérias nocivas que são ameaças graves para a saúde. Carne, produtos lácteos, e produtos de aves de capoeira são importantes reservatórios para muitos os patogénicos de origem alimentar, incluindo Salmonella, Campylobacter, Listeria e Escherichia coli O157: H7. Subprodutos de animais, tais como alimentação suplementos, também pode transmitir agentes patogénicos para animais alimentar (por exemplo, Salmonella e encefalopatia espongiforme bovina). Frutos do mar é outra fonte potencial de patógenos de origem alimentar, tais como Vibrio, Listeria, e hepatite a. infecciosa doses de muitos destes patógenos são muito baixas (~ 10 células bacterianas), aumentando a vulnerabilidade dos idosos, crianças e pessoas com deficiências imunológicas ou órgão transplantes.