Quando una persona che è già stato infettato con HIV viene infettato da un ceppo in secondo luogo, diverso di HIV. Superinfezione può causare l'HIV avanzare più velocemente. Superinfezione può anche complicare trattamento se acquisito ceppo del virus HIV è resistente ai farmaci antiretrovirali (ARV) nell'attuale regime di trattamento dell'HIV di persona.