Kehadiran mikroorganisme dalam makanan adalah kejadian yang alami dan tidak dapat dihindari. Memasak umumnya menghancurkan sebagian besar bakteri berbahaya, tetapi makanan matang, siap-untuk-makan makanan olahan, dan makanan diproses minimal dapat mengandung bakteri berbahaya yang ancaman kesehatan yang serius. Daging, susu, dan produk unggas waduk penting bagi banyak patogen ditanggung makanan, termasuk Salmonella, Campylobacter, Listeria Escherichia coli O157: H7. Dedak hewan seperti feed suplemen, mungkin juga mengirimkan patogen untuk makanan hewan (misalnya, Salmonella dan bovine spongiform encephalopathy). Seafood potensial lain sumber makanan yang bertalian patogen seperti Vibrio, Listeria, dan Hepatitis A. menular dosis banyak patogen ini sangat rendah (~ 10 sel bakteri), meningkatkan kerentanan orang tua, bayi, dan orang-orang dengan kekurangan imunologis atau organ transplantasi.