Přítomnost mikroorganismů v potravinách je přirozené a nevyhnutelné události. Obecně vaření zničí většinu škodlivých bakterií, ale nedostatečně tepelně upravené potraviny, zpracované potraviny připravené k jídlu a minimálně zpracované potraviny může obsahovat škodlivé bakterie, které jsou závažného ohrožení zdraví. Maso, mléčné výrobky, a důležité nádrže pro mnoho patogenů původcem v potravinách, včetně salmonely, Campylobacter, Listeria a Escherichia coli nepasteurovaných jsou produkty z drůbeže. Vedlejší produkty živočišného původu, jako například podávání stravy, mohou rovněž předávat patogenů na potravinové zvířata (např. salmonely a bovinní spongiformní encefalopatie). Dalším potenciálním zdrojem potravou patogenů, jako například Vibrio, Listeria, je mořské plody a hepatitidy A. infekční dávky mnoha z těchto patogenů, jsou velmi nízké (~ 10 bakteriálních buněk), zvyšují zranitelnost seniory, kojence a lidí s imunologickou nedostatky nebo varhany transplantace.