Когато дадено лице, което е вече заразени с ХИВ се зарази с второ, различни щам на ХИВ. Суперинфекция може да накара ХИВ да преминете напред по-бързо. Суперинфекция може също да усложняват третиране, ако наскоро придобитите щам на ХИВ е устойчив на антиретровирусна (ARV) наркотици в режим на третиране на текущата ХИВ на лицето.