دراسة عمليات الأرصاد الجوية الصغيرة المرتبطة بالتفاعل بين الغلاف الجوي واليابسة. شرط الحدود الدنيا للغلاف الجوي والحدود العليا شرطا الكامنة وراء التربة أو المياه تتحدد بالتفاعلات التي تحدث في أدنى طبقات الغلاف الجوي. بخار الزخم، الحرارة، المياه ومختلف الغازات والجسيمات ينقلون عمودياً من الاضطراب في طبقة الغلاف الجوي الحدود وبذلك إنشاء البيئة من النباتات والحيوانات على السطح. هذه التبادلات مهمان في إمداد الطاقة وبخار الماء في الغلاف الجوي، التي تحدد أنماط الطقس والمناخ على نطاق واسع في نهاية المطاف. وتشمل ميكروميتيورولوجي أيضا دراسة كيف تنتشر ملوثات الهواء ونقلها داخل الطبقة الحدودية وترسب الملوثات على السطح.